Αν χάσεις emails τότε με το backup της βάσης θα τα βρεις, με λίγο παίδεμα. Αλλά επειδή ο Exchange είναι άμεσα συνδεδεμένος με το Active Directory, πρέπει να το παίρνεις και αυτό. Αν δεν έχεις κάποιο Backup προϊόν (π.χ. DPM, Veeam κλπ) τότε καλύτερα να χρησιμοποιήσεις το Windows Server backup που είναι application aware (δηλαδή καταλαβαίνει ότι έχεις Exchange και κάνει τα ανάλογα check για το Backup).
Εδώ περιγράφετε πού καλά το πως να το χρησιμοποιήσεις:
Exchange 2013 https://technet.microsoft.com/en-us/library/dd876854(v=exchg.150).aspx
AD DS: https://technet.microsoft.com/en-us/library/cc816584(v=ws.10).aspx